第284章 模型構建成功，相信就完事了
第284章 模型構建成功，相信就完事了
為儘快完成底層模型的構建，國際數學挑戰研究院酶催化議題小組，在春節假期也並未完全停止工作，基本上每天都能看到進度增長，其效率相比剛開始的那兩個月可以說是大幅度提升。
終究其主要原因，正是徐銘取得的關鍵性突破。
如果說之前，他們是在不同的道路上，頻繁試錯，浪費掉大量的精力。
那麼在徐銘有了關鍵性突破後，則好比終於踏足到正確的道路，接下來只需要大步衝上終點即可。
自然不能同日而語。
伴隨著時間一分一秒流逝，轉眼進入到五月份。
月底再次臨近每年的定時保留節目，原本平淡的網絡上又重新熱鬧起來。
開始關注即將到來的高考。
只不過網友討論的重點，和往年相比卻顯得有點偏。
紛紛猜測今年會有多少道高考題和徐銘有關。
畢竟一月份剛結束的國家科學技術獎勵大會，可稱得上國內科學界的大事件。
隨便點進熱搜榜上，和高考有關的話題，便能看到大量類似的留言。
「馬上又要高考了，今年的高考題，徐院估計會直接霸榜刷屏吧？」
「這不是很正常的事。」
「建議高考生，抓緊把徐院的傳奇經歷，全部背下來。」
「開始押題了。」
「說實話有點羨慕現在的考生，尤其是打算報考數學專業的，基本上只要能考上研究生的話，以現在數學界的形式未來發展不會低。」
「今年燕大數院的招生標準，估計還要提高。」
「到時候報考數學專業的人數，應該會繼續創新高。」
「不單單是數學專業，化學也前景很高，要是酶催化的難題再給解決，到時候會變成什麼樣想都不敢想。」
「啥時候能讓徐院幫忙出高考題，我感覺絕對可以考哭很多人。」
與此同時。
國際數學挑戰研究院某討論室內，徐銘和舒爾茨以及許逸陽等數位組員，正在針對構建的模型展開討論。
他肯定沒有時間，去給高考生出題。
經過幾個月的構建和驗證優化，他們總算弄出了核心理論底層模型。
徐銘和組員，最終構建出一個多尺度動態計算模型。
使用密度泛函理論，計算關鍵鍵斷裂時，所形成的精確能量。
同時藉助機器學習力場，進行微秒級別的分子動力學模擬，捕捉蛋白質骨架的呼吸」如何影響活性中心。
而裡面最重要創新，則是徐銘引入了他證明數學猜想時構建的復幾何流形」概念，將整個系統數百萬個原子的運動，映射到一個高維空間的能量地形圖」上。
酶的催化路徑，就是這條複雜地形上的，最小作用量測地線。
當這項全新的多尺度動態計算模型構建出來，他便立刻申請了超級計算機算力。
截止今天，超算已經進行了，不間斷的一個月模擬。
只要得出具體的分子，那麼他們國際數學挑戰研究院的任務就算完成，後續便輪到化學所那邊，進行具體的合成實驗來確定人工酶動力學數值。
儘管整個過程並未遇到無法解決的瓶頸，僅幾個月便走到了關鍵步驟。
但這並不代表酶催化議題，並沒有想像中的困難。
如果換做其他團隊，恐怕第一步就會被困死，幾年甚至十幾年不會迎來突破。
現代化學的絕症，這句話可不是單純說說。
「院長。」
「計算中心那邊，把多尺度動態計算模型輸出的結果傳輸過來了。」
房間內，實力最弱的許逸陽，擔任起匯報工作，邊說邊把模型輸出的結果，在正前方屏幕上播放，整個過程操作的速度非常流暢。
這時包括徐銘在內的所有人，目光全部牢牢緊盯著視野中的屏幕。
儘管面色上顯得還算平靜，但桌子底下緊攥著的手掌卻暴露出，此刻大家的心情都非常激動。
既迫不及待想看到結果，又擔心會失望。
為了構建這項多尺度動態計算模型，這幾個月時間裡大家沒少付出精力和時間，可以說對其寄予了厚望，是能否成功攻克酶催化議題的關鍵。
在超算不間斷的計算期間，有人甚至罕見的，出現了失眠的症狀。
主要酶催化項目，早已和國際數學挑戰研究院，深層次的綁定。
越早完成酶催化的研究，越能展現出，國際數學挑戰研究院的重要程度。
確確實實能左右人類文明的發展。
然伴隨著模型輸出數值進入大家的視野，眾人眉宇間頓時被一股凝重之色所占據。
「模型竟然沒有給出一個具體的分子？」
是的。
讓大家期待的分子並未出現，僅僅輸出了一組理想活躍口袋的約束條件。
徐銘暫時沒去關注大家的反應，他把注意力放在那組條件上面，同時大腦正在飛速運轉推導分析。
「精確到皮米尺度的靜電分布範圍，加上一個特定的氫鍵網絡拓撲結構、以及另外一個關於局部疏水性的三維梯度要求。」
□中自顧自低喃著，依舊呈現出自信神色。
正當他做出結果判斷時，耳旁響起舒爾茨的聲音。
「會不會是我們的多尺度動態計算模型，仍舊存在著我們尚未發現的問題，所以才無法輸出具體分子結構？」
「不排除這種可能性。」旁邊一位國內數學專家組員接過話茬附和。
兩個人的話，也頓時打開討論的話匣子。
紛紛跟在後面發言。
「模型經過了多番驗證，不可能存在問題。」
「當務之急，必須儘快找到原因，化學所那邊的工作應該暫緩。」
按照原本的計劃，如果不出意外的話，只要等超算輸出模型的結果，化學所便能開始開展合成實驗，這對他們來講無疑是最令人高興的消息。
但現在的情況，似乎要有所延後才行。
當然大家探討歸探討，最後還是把目光，全部集中到了徐銘身上。
聽從徐銘的最終決定。
畢竟整個酶催化項目，徐銘才是核心。
心中早就有了計較的徐銘，面對眼下狀況，他自然不會過多耽擱時間，下秒便開口表明自己的觀點和決定。
「根據模型輸出結果，滿足所有這些條件的結構，在已知的蛋白質結構資料庫中不存在，我們需要創造一個新的蛋白質摺疊。」
此話一出，其他人不免有些意外。
根據模型輸出的條件，去構建一個新的蛋白質結構。
這其中的難度可想而知。
相比模型輸出具體分子結構，難度提高了數倍。
關鍵這份難度還不單單是他們研究院，化學所那邊同樣需要面臨挑戰。
儘管大家都對徐銘抱有絕對信任，但在這種討論會性質的場合中，肯定不會保持沉默隱藏自己的觀點。
所以緊接著還是指出了難點。
「創造新的蛋白質結構，這樣一來的話，我們和化學所都會面臨巨大難題。」
「這確實是一個很龐大的工程。」
「如果繼續從模型入手，對模型優化後，重新讓超算進行驗證，是不是能直接得到分子結構。」
「我相信院長的判斷。」
徐銘把大家的話悉數聽進耳中，對此並不覺得有什麼意外的地方。
他當然知道，單憑一組約束條件，就要構建新的蛋白質結構，屬於是專門給自己增加難度讓項目複雜化。
但卻已是當下最正確的選擇。
首先他對自己的多尺度動態計算模型，基本上胸有成竹毫不懷疑，既然超算未能輸出具體的一個分子，那麼就算想辦法優化也不會改變。
唯有自行創造新的蛋白質結構。
換做其他人，確實會被其中的難度嚇到，可他憑藉自身擁有的結果洞察能力，通過確認最正確的路線，構建出項目所需要的結構。
在這個過程中，甚至不需要多少實驗試錯。
念頭停留在這裡時，徐銘也懶得賣關子，過多去耽誤大家的時間。
隨即沉聲說明理由。
「我們的多尺度動態計算模型，是通過大家驗證的，我不認為輸出結果存在問題。」
「超算得到的結果已然很清楚。」
「在已知的蛋白質結構資料庫中，並不存在這種我們所需要的分子結構，必須想辦法重新構建一個。」
「起碼我們已經得到了約束條件，這會讓我們在實際構建中減少很多任務量。」
很快徐銘的話音落下，眾人聽完之後，也都表示認可微微點頭回應。
全票通過構建全新蛋白質結構的方案。
「那就定在下周，與化學所人員展開合作會議，儘快著手對全新蛋白質的構建。」
徐銘拍板做出決定，也算給整個議題的走向，再次定下了一個基調。
討論會進行到這裡，基本也算進入尾聲，後續的蛋白質全新結構構建，光靠國際數學挑戰研究院的人，顯然是沒有辦法具體展開的。
關鍵要看徐銘這個數學化學都精通的天才。
不過在宣布散會之前，徐銘突然想到了什麼，抬起視線看向大家隨口拋出一個問題。
「對了。」
「阿美瑞肯國家科學院方面，對酶催化的研究有沒有什麼新的進展？」
他早就看到過新聞，對面國家科學院，與其他國家實驗室達成了合作，共同來研究酶催化，其本質原因正是害怕他真的搞成。
想通過這種方法來平衡雙方的技術差距。
但有沒有用就另外一說了。
許逸陽本來還沉浸在，構建全新結構的話題中，聽到徐銘突然詢問起這件事情。
幾乎沒有經過任何思考，下意識如倒豆子般，把自己知道情況全部講出。
「截止他們宣布增加研究力度和成本後，到現在暫時沒有任何消息傳出。」
「說起來我還以為，他們會堅持到底呢。」其他人聽到這話笑著回了句。
畢竟國際數學挑戰研究院，剛宣布把酶催化列入數學基石計劃時，化學界和數學裡均是質疑聲音，堅定認為此項目根本不可能成功。
結果僅僅是暴露出，徐銘在光刻膠上有貢獻，並非對化學一點不熟。
便立刻慌慌張張跟著籌備此項目。
生怕當初半導體行業變革再發生一次。
但很遺憾，世界上只有一個徐銘，其他人或者科研團隊註定失敗。
「那今天就到這裡吧。」
徐銘聽完微微頷首回應，根本沒有把對面國家科學院的團隊放在心上。
縱使他把對酶催化議題的研發周期，拉長到幾年，照樣有把握大幅度領先海外。
很快時間來到六月份。
就在高考正式開始的前幾天，徐銘帶領國際數學挑戰研究院組員，順利同周啟深他們在化學所，舉行了一次相當正式的深入研討會。
在會議上，徐銘詳細講述了，目前處於的進度。
雖然國際數學挑戰研究院這邊，仍因模型輸出的約束條件結果，眉宇間若隱若無的夾雜著些許遺憾，可對周啟深和化學所其他人來講，則是完全被巨大的驚喜砸中。
甚至都有點做夢的感覺。
酶催化可不是什麼新的項目，在他們化學所手中都進展了幾年時間。
但卻始終沒有大的突破。
結果現在短短几個月的時間，竟直接構建出了多尺度動態計算底層模型，放在以前簡直想都不敢想。
哪怕只有約束條件，不是具體的分子結構，也比之前要強上太多太多。
這使得周啟深更加確信，主動找到徐銘，同國際數學挑戰研究院合作，絕對是他人生中最為正確的選擇。
況且他和徐銘合作過極紫外光刻膠，深知徐銘在化學領域是怎麼樣的存在。
所以聽完全部內容後，立刻便當場拍板表態。
「我們化學所這邊，保證會全力支持你，對新蛋白質結構的構建。」
「要如何著手你儘管安排，包括我在內。」
「不就是一個全新的蛋白質結構，我相信在大家的共同努力下，肯定能夠取得想要看到的結果。」
徐銘面對周啟深的支持，倒也沒和對方見外，索性現場為所有人規劃工作。
全程所展現出來的自信，使得大家深受感染，在不知不覺間也相信，關於酶催化的研究會成功，仿佛已經看到了工業被重塑後的場景。
為儘快完成底層模型的構建，國際數學挑戰研究院酶催化議題小組，在春節假期也並未完全停止工作，基本上每天都能看到進度增長，其效率相比剛開始的那兩個月可以說是大幅度提升。
終究其主要原因，正是徐銘取得的關鍵性突破。
如果說之前，他們是在不同的道路上，頻繁試錯，浪費掉大量的精力。
那麼在徐銘有了關鍵性突破後，則好比終於踏足到正確的道路，接下來只需要大步衝上終點即可。
自然不能同日而語。
伴隨著時間一分一秒流逝，轉眼進入到五月份。
月底再次臨近每年的定時保留節目，原本平淡的網絡上又重新熱鬧起來。
開始關注即將到來的高考。
只不過網友討論的重點，和往年相比卻顯得有點偏。
紛紛猜測今年會有多少道高考題和徐銘有關。
畢竟一月份剛結束的國家科學技術獎勵大會，可稱得上國內科學界的大事件。
隨便點進熱搜榜上，和高考有關的話題，便能看到大量類似的留言。
「馬上又要高考了，今年的高考題，徐院估計會直接霸榜刷屏吧？」
「這不是很正常的事。」
「建議高考生，抓緊把徐院的傳奇經歷，全部背下來。」
「開始押題了。」
「說實話有點羨慕現在的考生，尤其是打算報考數學專業的，基本上只要能考上研究生的話，以現在數學界的形式未來發展不會低。」
「今年燕大數院的招生標準，估計還要提高。」
「到時候報考數學專業的人數，應該會繼續創新高。」
「不單單是數學專業，化學也前景很高，要是酶催化的難題再給解決，到時候會變成什麼樣想都不敢想。」
「啥時候能讓徐院幫忙出高考題，我感覺絕對可以考哭很多人。」
與此同時。
國際數學挑戰研究院某討論室內，徐銘和舒爾茨以及許逸陽等數位組員，正在針對構建的模型展開討論。
他肯定沒有時間，去給高考生出題。
經過幾個月的構建和驗證優化，他們總算弄出了核心理論底層模型。
徐銘和組員，最終構建出一個多尺度動態計算模型。
使用密度泛函理論，計算關鍵鍵斷裂時，所形成的精確能量。
同時藉助機器學習力場，進行微秒級別的分子動力學模擬，捕捉蛋白質骨架的呼吸」如何影響活性中心。
而裡面最重要創新，則是徐銘引入了他證明數學猜想時構建的復幾何流形」概念，將整個系統數百萬個原子的運動，映射到一個高維空間的能量地形圖」上。
酶的催化路徑，就是這條複雜地形上的，最小作用量測地線。
當這項全新的多尺度動態計算模型構建出來，他便立刻申請了超級計算機算力。
截止今天，超算已經進行了，不間斷的一個月模擬。
只要得出具體的分子，那麼他們國際數學挑戰研究院的任務就算完成，後續便輪到化學所那邊，進行具體的合成實驗來確定人工酶動力學數值。
儘管整個過程並未遇到無法解決的瓶頸，僅幾個月便走到了關鍵步驟。
但這並不代表酶催化議題，並沒有想像中的困難。
如果換做其他團隊，恐怕第一步就會被困死，幾年甚至十幾年不會迎來突破。
現代化學的絕症，這句話可不是單純說說。
「院長。」
「計算中心那邊，把多尺度動態計算模型輸出的結果傳輸過來了。」
房間內，實力最弱的許逸陽，擔任起匯報工作，邊說邊把模型輸出的結果，在正前方屏幕上播放，整個過程操作的速度非常流暢。
這時包括徐銘在內的所有人，目光全部牢牢緊盯著視野中的屏幕。
儘管面色上顯得還算平靜，但桌子底下緊攥著的手掌卻暴露出，此刻大家的心情都非常激動。
既迫不及待想看到結果，又擔心會失望。
為了構建這項多尺度動態計算模型，這幾個月時間裡大家沒少付出精力和時間，可以說對其寄予了厚望，是能否成功攻克酶催化議題的關鍵。
在超算不間斷的計算期間，有人甚至罕見的，出現了失眠的症狀。
主要酶催化項目，早已和國際數學挑戰研究院，深層次的綁定。
越早完成酶催化的研究，越能展現出，國際數學挑戰研究院的重要程度。
確確實實能左右人類文明的發展。
然伴隨著模型輸出數值進入大家的視野，眾人眉宇間頓時被一股凝重之色所占據。
「模型竟然沒有給出一個具體的分子？」
是的。
讓大家期待的分子並未出現，僅僅輸出了一組理想活躍口袋的約束條件。
徐銘暫時沒去關注大家的反應，他把注意力放在那組條件上面，同時大腦正在飛速運轉推導分析。
「精確到皮米尺度的靜電分布範圍，加上一個特定的氫鍵網絡拓撲結構、以及另外一個關於局部疏水性的三維梯度要求。」
□中自顧自低喃著，依舊呈現出自信神色。
正當他做出結果判斷時，耳旁響起舒爾茨的聲音。
「會不會是我們的多尺度動態計算模型，仍舊存在著我們尚未發現的問題，所以才無法輸出具體分子結構？」
「不排除這種可能性。」旁邊一位國內數學專家組員接過話茬附和。
兩個人的話，也頓時打開討論的話匣子。
紛紛跟在後面發言。
「模型經過了多番驗證，不可能存在問題。」
「當務之急，必須儘快找到原因，化學所那邊的工作應該暫緩。」
按照原本的計劃，如果不出意外的話，只要等超算輸出模型的結果，化學所便能開始開展合成實驗，這對他們來講無疑是最令人高興的消息。
但現在的情況，似乎要有所延後才行。
當然大家探討歸探討，最後還是把目光，全部集中到了徐銘身上。
聽從徐銘的最終決定。
畢竟整個酶催化項目，徐銘才是核心。
心中早就有了計較的徐銘，面對眼下狀況，他自然不會過多耽擱時間，下秒便開口表明自己的觀點和決定。
「根據模型輸出結果，滿足所有這些條件的結構，在已知的蛋白質結構資料庫中不存在，我們需要創造一個新的蛋白質摺疊。」
此話一出，其他人不免有些意外。
根據模型輸出的條件，去構建一個新的蛋白質結構。
這其中的難度可想而知。
相比模型輸出具體分子結構，難度提高了數倍。
關鍵這份難度還不單單是他們研究院，化學所那邊同樣需要面臨挑戰。
儘管大家都對徐銘抱有絕對信任，但在這種討論會性質的場合中，肯定不會保持沉默隱藏自己的觀點。
所以緊接著還是指出了難點。
「創造新的蛋白質結構，這樣一來的話，我們和化學所都會面臨巨大難題。」
「這確實是一個很龐大的工程。」
「如果繼續從模型入手，對模型優化後，重新讓超算進行驗證，是不是能直接得到分子結構。」
「我相信院長的判斷。」
徐銘把大家的話悉數聽進耳中，對此並不覺得有什麼意外的地方。
他當然知道，單憑一組約束條件，就要構建新的蛋白質結構，屬於是專門給自己增加難度讓項目複雜化。
但卻已是當下最正確的選擇。
首先他對自己的多尺度動態計算模型，基本上胸有成竹毫不懷疑，既然超算未能輸出具體的一個分子，那麼就算想辦法優化也不會改變。
唯有自行創造新的蛋白質結構。
換做其他人，確實會被其中的難度嚇到，可他憑藉自身擁有的結果洞察能力，通過確認最正確的路線，構建出項目所需要的結構。
在這個過程中，甚至不需要多少實驗試錯。
念頭停留在這裡時，徐銘也懶得賣關子，過多去耽誤大家的時間。
隨即沉聲說明理由。
「我們的多尺度動態計算模型，是通過大家驗證的，我不認為輸出結果存在問題。」
「超算得到的結果已然很清楚。」
「在已知的蛋白質結構資料庫中，並不存在這種我們所需要的分子結構，必須想辦法重新構建一個。」
「起碼我們已經得到了約束條件，這會讓我們在實際構建中減少很多任務量。」
很快徐銘的話音落下，眾人聽完之後，也都表示認可微微點頭回應。
全票通過構建全新蛋白質結構的方案。
「那就定在下周，與化學所人員展開合作會議，儘快著手對全新蛋白質的構建。」
徐銘拍板做出決定，也算給整個議題的走向，再次定下了一個基調。
討論會進行到這裡，基本也算進入尾聲，後續的蛋白質全新結構構建，光靠國際數學挑戰研究院的人，顯然是沒有辦法具體展開的。
關鍵要看徐銘這個數學化學都精通的天才。
不過在宣布散會之前，徐銘突然想到了什麼，抬起視線看向大家隨口拋出一個問題。
「對了。」
「阿美瑞肯國家科學院方面，對酶催化的研究有沒有什麼新的進展？」
他早就看到過新聞，對面國家科學院，與其他國家實驗室達成了合作，共同來研究酶催化，其本質原因正是害怕他真的搞成。
想通過這種方法來平衡雙方的技術差距。
但有沒有用就另外一說了。
許逸陽本來還沉浸在，構建全新結構的話題中，聽到徐銘突然詢問起這件事情。
幾乎沒有經過任何思考，下意識如倒豆子般，把自己知道情況全部講出。
「截止他們宣布增加研究力度和成本後，到現在暫時沒有任何消息傳出。」
「說起來我還以為，他們會堅持到底呢。」其他人聽到這話笑著回了句。
畢竟國際數學挑戰研究院，剛宣布把酶催化列入數學基石計劃時，化學界和數學裡均是質疑聲音，堅定認為此項目根本不可能成功。
結果僅僅是暴露出，徐銘在光刻膠上有貢獻，並非對化學一點不熟。
便立刻慌慌張張跟著籌備此項目。
生怕當初半導體行業變革再發生一次。
但很遺憾，世界上只有一個徐銘，其他人或者科研團隊註定失敗。
「那今天就到這裡吧。」
徐銘聽完微微頷首回應，根本沒有把對面國家科學院的團隊放在心上。
縱使他把對酶催化議題的研發周期，拉長到幾年，照樣有把握大幅度領先海外。
很快時間來到六月份。
就在高考正式開始的前幾天，徐銘帶領國際數學挑戰研究院組員，順利同周啟深他們在化學所，舉行了一次相當正式的深入研討會。
在會議上，徐銘詳細講述了，目前處於的進度。
雖然國際數學挑戰研究院這邊，仍因模型輸出的約束條件結果，眉宇間若隱若無的夾雜著些許遺憾，可對周啟深和化學所其他人來講，則是完全被巨大的驚喜砸中。
甚至都有點做夢的感覺。
酶催化可不是什麼新的項目，在他們化學所手中都進展了幾年時間。
但卻始終沒有大的突破。
結果現在短短几個月的時間，竟直接構建出了多尺度動態計算底層模型，放在以前簡直想都不敢想。
哪怕只有約束條件，不是具體的分子結構，也比之前要強上太多太多。
這使得周啟深更加確信，主動找到徐銘，同國際數學挑戰研究院合作，絕對是他人生中最為正確的選擇。
況且他和徐銘合作過極紫外光刻膠，深知徐銘在化學領域是怎麼樣的存在。
所以聽完全部內容後，立刻便當場拍板表態。
「我們化學所這邊，保證會全力支持你，對新蛋白質結構的構建。」
「要如何著手你儘管安排，包括我在內。」
「不就是一個全新的蛋白質結構，我相信在大家的共同努力下，肯定能夠取得想要看到的結果。」
徐銘面對周啟深的支持，倒也沒和對方見外，索性現場為所有人規劃工作。
全程所展現出來的自信，使得大家深受感染，在不知不覺間也相信，關於酶催化的研究會成功，仿佛已經看到了工業被重塑後的場景。